マッドハッターを救うため、アリスは再びワンダーランドへ行きそして時間をさかのぼる冒険へ。

運命に立ち向かう彼女を待つのは、秘められた真実と時間の番人“タイム”。
摩訶不思議な世界でチェシャ猫たちや“赤”と“白”の女王たちも登場し、過去の秘密が明かされる。

はたしてアリスはマッドハッターを、そしてワンダーランドを救うことができるのか？